博客
关于我
功能核磁共振影像分析AFNI教程(3)
阅读量:631 次
发布时间:2019-03-14

本文共 2307 字,大约阅读时间需要 7 分钟。

Processing block: regress

预处理模块:回归
这是单被试分析中的主要步骤-对我们的模型进行回归分析。我们的回归模型由几个简单的部分组成:
1.多项式基线,用于说明扫描的平均值
以及缓慢的基线漂移
2.对兴趣刺激的反应
3.运动参数,意在解决残余运动影响 ,3dvolreg无法完美纠正

The proc.FT script:      3dDeconvolve -input pb04.$subj.r??.scale+orig.HEAD                   \          -polort 3                                                        \          -num_stimts 8                                                    \          -stim_times 1 stimuli/AV1_vis.txt 'BLOCK(20,1)'                  \          -stim_label 1 Vrel                                               \          -stim_times 2 stimuli/AV2_aud.txt 'BLOCK(20,1)'                  \          -stim_label 2 Arel                                               \          -stim_file 3 dfile.rall.1D'[0]' -stim_base 3 -stim_label 3 roll  \          -stim_file 4 dfile.rall.1D'[1]' -stim_base 4 -stim_label 4 pitch \          -stim_file 5 dfile.rall.1D'[2]' -stim_base 5 -stim_label 5 yaw   \          -stim_file 6 dfile.rall.1D'[3]' -stim_base 6 -stim_label 6 dS    \          -stim_file 7 dfile.rall.1D'[4]' -stim_base 7 -stim_label 7 dL    \          -stim_file 8 dfile.rall.1D'[5]' -stim_base 8 -stim_label 8 dP    \          -gltsym 'SYM: Vrel -Arel'                                        \          -glt_label 1 V-A                                                 \          -fout -tout -x1D X.xmat.1D -xjpeg X.jpg                          \          -fitts fitts.$subj                                               \          -errts errts.$subj                                               \          -bucket stats.$subj

3dDeconvolve的输入是“scale”数据集的列表。 请注意-input选项的参数为pb04.$ subj.r ??.scale + orig.HEAD。

此通配符表达式(“ ??”字符正好等于2个字符
匹配模式)匹配以pb04。$ subj开头的所有文件
'r’和任意2个字符(在我们的情况下为数字),后缀为
‘.scale + orig.HEAD’。

接下来的两对选项指定了感兴趣的回归变量。 首先

这对是“视觉可靠”的刺激类。

-stim_times 1 stimuli / AV1_vis.txt'BLOCK(20,1)'\     -stim_label 1 Vrel 这告诉3dDeconvolve每次在stimuli / AV1_vis.txt中都有 应该是对20秒的刺激的BOLD 回应。 每个卷积的粗体响应将持续约35秒。

最后的选项如下:

-fout -tout -x1D X.xmat.1D -xjpeg X.jpg \     -fitts fitts。$ subj \     -errts errts。$ subj \     桶统计信息。$ subj -fout和-tout选项告诉3dDeconvolve输出F状态和t状态在适当的时候。 -x1D选项指定要在其中写入X矩阵的文件的名称 文本形式,而-xjpeg指定用于写入图像版本的名称。 这两个文件都代表X矩阵,但是它们给出了不同的观点。

最后3个选项用于输出数据集。 -fitts数据集如下所示该模型尽可能适合数据。 -errts数据集是错误时间序列数据或残差。 它等于输入减去fitts。最后一个选项-bucket指定3dDeconvolve应该将所有Beta权重和统计量。

转载地址:http://tvxoz.baihongyu.com/

你可能感兴趣的文章
MySQL5.6的zip包安装教程
查看>>
mysql5.7 for windows_MySQL 5.7 for Windows 解压缩版配置安装
查看>>
Webpack 基本环境搭建
查看>>
mysql5.7 安装版 表不能输入汉字解决方案
查看>>
MySQL5.7.18主从复制搭建(一主一从)
查看>>
MySQL5.7.19-win64安装启动
查看>>
mysql5.7.19安装图解_mysql5.7.19 winx64解压缩版安装配置教程
查看>>
MySQL5.7.37windows解压版的安装使用
查看>>
mysql5.7免费下载地址
查看>>
mysql5.7命令总结
查看>>
mysql5.7安装
查看>>
mysql5.7性能调优my.ini
查看>>
MySQL5.7新增Performance Schema表
查看>>
Mysql5.7深入学习 1.MySQL 5.7 中的新增功能
查看>>
Webpack 之 basic chunk graph
查看>>
Mysql5.7版本单机版my.cnf配置文件
查看>>
mysql5.7的安装和Navicat的安装
查看>>
mysql5.7示例数据库_Linux MySQL5.7多实例数据库配置
查看>>
Mysql8 数据库安装及主从配置 | Spring Cloud 2
查看>>
mysql8 配置文件配置group 问题 sql语句group不能使用报错解决 mysql8.X版本的my.cnf配置文件 my.cnf文件 能够使用的my.cnf配置文件
查看>>